《外科风云》这部剧讲述了在现代化综合性的仁合医院里，由一起29年前发生的“事故”所引发的故事。剧中林欢其实是庄恕的妹妹，两人小时候分开，时隔多年再重逢。长大后的林欢成为了出色的大提琴音乐家，不同的成长环境让两人之间横生诸多的隔阂障碍。
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庄恕表面冷峻深沉，怀着秘密回国在仁合医院当胸外科专家，也招惹到其他医院的眼红。不过庄恕并不理会这些，他只是想为母亲还原清白而已，况且当年的事故并没有想象中的那么简单，还出触及到医院内部人员的关系，所以掀起一番《外科风云》。
其实庄恕的妹妹就是大提琴音乐家林欢，是个文艺范儿十足的女生，可是因为29年一桩“事故”的引发，导致兄妹两人时隔多年后再度重逢，却因为各自的经历已经不相识了，但是他们却意外发现了对方就是自己的哥哥和妹妹，最终他们会相认吗?
城仁和医院，护士张淑梅被质疑用错药而导致病人死亡被迫离开岗位，4岁女儿被人贩拐，张淑梅精神恍惚并在两年后被车祸夺去生命。多年后面对妹妹林欢时，这让有血缘之亲却难以相认的哥哥庄恕痛苦不已，面对生死，人物复杂的关系和身世让身怀绝技的医生也束手无策，不过最后庄恕和妹妹林欢还是想相认了。
但是曾一度让拥有血缘之亲的哥哥庄恕，有些难以相信，而在面对生死面前谁都束手无措。不过这沉浮隐瞒多年的真相，最终还是会浮出水面。
